(įsteigta 1920 m.)
| 1. | ABELIO BALOŠERIO BIBLIOTEKOS, veikusios Kaune 1901-1940 m., KATALOGAI | F 67 | 66 saug.vnt. | 1910-1940 |
| 2. | CARO KARIUOMENĖS PULKAI LIETUVOJE | F 107 | 230 laik.saug.vnt. | 1819-1917 |
| 3. | CHORAS "ECHO" VILNIUJE | F 199 | 15 laik.saug.vnt. | 1928-1935 |
| 4. | DABROVOLĖS V. MARIJAMPOLĖS A. (dabar Vilkaviškio raj.) VAITO ARCHYVAS | F 136 | 82 saug.vnt. | 1810-1919 |
| 5. | DRAUGIJŲ JUNGTINIS FONDAS:"Apšvieta", "Kanklės", "Lietuvos Jaunimo sąjunga", "Saulė", "Šviesa", "Žagrė" ir kt. | F 106 | 283 saug.vnt. | 1905-1938 |
| 6. | JAUNŲJŲ ŪKININKŲ RATELIŲ REFERATŲ KOLEKCIJA | F 195 | 65 laik.saug.vnt. | 1935-1940 |
| 7. | JĖZUITŲ GIMNAZIJA | F 198 | 25 laik.saug.vnt. | 1935-1939 |
| 8. | KAUNO RADIJO STOTIS (veikė 1923-1944 m.) ir VALSTYBĖS RADIOFONAS (veikė 1926-1944 m.) | F 157 | 50 saug.vnt. | 1923-1939 |
| 9. | KIDULIŲ VALSČIAUS (Marijampolės a., Augustavo gub.) GIRININKIJA | F 163 | 2 saug.vnt. | 1842-1852 |
| 10. | KLAIPĖDOS KRAŠTO ISTORINIAI AKTAI | F 104 | 121 laik.saug.vnt. | 1750-1936 |
| 11. | LIETUVOS FOTOMĖGĖJŲ SĄJUNGA (įkurta 1933 m.) | F 144 | 61 saug.vnt. | 1933-1940 |
| 12. | LIETUVOS MOTERŲ TARYBA (įkurta 1929 m.) | F 159 | 21 saug.vnt. | 1930-1940 |
| 13. | LIETUVOS NACIONALINĖ MARTYNO MAŽVYDO BIBLIOTEKA | F 131 | 100 laik.saug.vnt. | 1947-1980 |
| 14. | LIETUVOS NACIONALINĖS MARTYNO MAŽVYDO BIBLIOTEKOS BUV. SPEC. SAUGOJIMO SKYRIAUS FONDAS | F 178 | 151 saug.vnt. | 1947-1991 |
| 15. | LENKŲ JAUNIMO SĄJUNGA | F 194 | 20 laik.saug.vnt. | 1925-1939 |
| 16. | MAŽOSIOS LIETUVOS ISTORINIAI AKTAI | F 103 | 910 saug.vnt. | 1585-1944 |
| 17. | "MINTIS" (lietuvių spaustuvė ir leidykla Sidnėjuje, įsteigta 1951 m.) | F 188 | 135 saug.vnt. | 1951-1994 |
| 18. | PASAULINĖS KATALIKŲ SPAUDOS PARODOS VATIKANE LIETUVIŲ SKYRIUI ORGANIZUOTI KOMITETAS ( veikė 1935-1938 m.) | F 158 | 47 saug.vnt. | 1935-1938 |
| 19. | P. ŠLUTIENĖS ORGANIZACIJOS (LITHUANIAN MERCY LIFT) ARCHYVAS | F 213 | 159 laik.saug.vnt. | 1993-2008 |
| 20. | TELŠIŲ LENKŲ PROGIMNAZIJA (įsteigta 1920 m.) | F 154 | 16 saug.vnt. | 1920-1925 |
| 21. | VILNIAUS ŽYDŲ MOKYTOJŲ INSTITUTAS (1844-1873 m. Vilniaus rabinų mokykla) | F 193 | 36 laik.saug.vnt. | 1845-1918 |
| 22. | ŽIBURYS (švietimo ir labdaros draugija, veikė 1906-1940 m.) | F 197 | 122 laik.saug.vnt. | 1906-1938 |
